试用期三个月过去了，现在提前三天申请退休，

公司不合法。依据《劳动合同法》，试用期有明确规定，三个月的劳动合同试用期应不超过一个月。公司若坚持错误做法，可能损害员工权益，影响员工正常退休及福利享受。
✫✫✫✫✫有法律问题，请打电话15555555523（123中间8个5），微信同号，免费咨询✫✫✫✫✫
可申请劳动仲裁或与公司协商。面对公司不合理要求，建议先与公司人事沟通，说明法律规定；若沟通无果，可向劳动仲裁委员会提起仲裁，维护自身合法权益。
✫✫✫✫✫有法律问题，请打电话15555555523（123中间8个5），微信同号，免费咨询✫✫✫✫✫
公司不合法。应对方式：1.与公司人事部门沟通，明确指出试用期法律规定的时长，要求按法办理退休；2.若公司拒绝，收集劳动合同等证据，向当地劳动仲裁委员会提起仲裁申请；3.等待仲裁结果，若仍不满意，可进一步寻求法律援助或提起诉讼。